本分局置分局長一名綜理本分局勤、業務、副分局長一名襄助分局長處理本分局勤、業務，另置一、二、三、四、五組、偵查隊、警備隊及勤務指揮中心；並下設埔里派出所、愛蘭派出所、鯉潭派出所、隆生派出所、桃米派出所、史港派出所、合成派出所、國姓分駐所、北山派出所、長壽派出所、長流派出所、梅林派出所及埔里交通分隊。
