本分局置分局長一名綜理本分局勤、業務、副分局長一名襄助分局長處理本分局勤、業務，另置一、二、三、四組、偵查隊、警備隊及勤務指揮中心；並下設伊達邵派出所、頭社派出所、日月潭派出所、東光派出所、五城派出所、郡坑派出所、魚池分駐所、車埕派出所、水里分駐所、隘寮派出所、集集派出所及事故處理小隊。
